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Human Gene Set: GOBP_UBIQUITIN_DEPENDENT_PROTEIN
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Standard name | GOBP_UBIQUITIN_DEPENDENT_PROTEIN_CATABOLIC_PROCESS_VIA_THE_C_END_DEGRON_RULE_PATHWAY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Systematic name | M42987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Brief description | The chemical reactions and pathways resulting in the breakdown of a protein or peptide covalently tagged with ubiquitin, via the DesCEND (destruction via C-end degron) pathway. In the DesCEND pathway, C-terminal residues (C-end degrons) in substrates are recognized by Cul2-RING and Cul4-RING E3 ligases, whereupon the substrates are linked to ubiquitin and then delivered to the proteasome for degradation. C-end degrons can be present in full-length proteins, truncated proteins or proteolytically cleaved forms. [PMID:29775578, PMID:29779948] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full description or abstract | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Collection | C5: Ontology GO: Gene Ontology GO:BP: GO Biological Process |
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Source publication | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exact source | GO:0140627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Related gene sets | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External links | http://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0140627 |
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Filtered by similarity ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Contributed by | Gene Ontology (Gene Ontology Consortium) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source platform or identifier namespace |
Human_NCBI_Gene_ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dataset references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Download gene set | format: grp | gmt | xml | json | TSV metadata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Compute overlaps ? |
(show collections to investigate for overlap with this gene set)
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Compendia expression profiles ? |
NG-CHM interactive heatmaps (Please note that clustering takes a few seconds) Legacy heatmaps (PNG) |
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Advanced query | Further investigate these 12 genes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene families ? | Categorize these 12 genes by gene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Show members |
(show 12 source identifiers mapped to 12 genes)
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Version history |
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