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Human Gene Set: KEGG_MEDICUS_VARIANT_MUTATION
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Standard name | KEGG_MEDICUS_VARIANT_MUTATION_INACTIVATED_OPTN_TO_PINK_PARKIN_MEDIATED_AUTOPHAGOSOME_FORMATION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Systematic name | M47742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Brief description | Pathway Definition from KEGG: PINK1 -> PRKN -> (CISD1,CISD2,FAF2,FKBP8,TOMM70,HK1) // OPTN* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full description or abstract | Mutation-inactivated OPTN to PINK-Parkin-mediated autophagosome formation. Pathway ID: N01138. Pathway type: Variant. Pathway class: nt06464 Amyotrophic lateral sclerosis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Collection | C2: Curated CP: Canonical Pathways CP:KEGG_MEDICUS: KEGG Medicus Pathways |
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Source publication | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exact source | N01138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Related gene sets | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External links | https://www.kegg.jp/entry/N01138 |
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Filtered by similarity ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Contributed by | KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source platform or identifier namespace |
Human_NCBI_Gene_ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dataset references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Download gene set | format: grp | gmt | xml | json | TSV metadata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Compute overlaps ? |
(show collections to investigate for overlap with this gene set)
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Compendia expression profiles ? |
NG-CHM interactive heatmaps (Please note that clustering takes a few seconds) Legacy heatmaps (PNG) |
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Advanced query | Further investigate these 9 genes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene families ? | Categorize these 9 genes by gene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Show members |
(show 9 source identifiers mapped to 9 genes)
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Version history | 2023.2.Hs: First Introduced. |
See MSigDB license terms here. Please note that certain gene sets have special access terms.